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美国NIST RM 8375 微生物基因组DNA标准品

美国NIST RM 8375 微生物基因组DNA标准品
Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment
(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004) 规格:4 vials, 1 each
本参考物质(RM)用于微生物全基因组测序的验证、优化、过程评估和性能评估。

  • 产品型号:
  • 厂商性质:生产厂家
  • 更新时间:2025-12-02
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产品详情

美国NIST RM 8375 微生物基因组DNA标准品

货号:RM 8375

品牌:美国NIST

英文名称:

Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment

(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

中文名称:用于测序性能评估的微生物基因组DNA标准品 (MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

产品规格: 4 vials, 1 each

产品用途:

本参考物质(RM)用于微生物全基因组测序的验证、优化、过程评估和性能评估。特别关注了对基因序列的评估。RM 8375的单位由四个小瓶组成。每个小瓶含有不同的微生物基因组DNA样本(MG-001、MG-002、MG-003铜绿假单胞菌和MG-004产孢梭菌)。

该材料旨在帮助评估高通量微生物DNA测序方法的性能。这种基因组DNA是从细胞培养物中提取的。由于RM是提取的DNA,因此它不评估DNA提取等预分析步骤。然而,它确实对测序库的准备、测序机、碱基调用算法以及随后的生物信息学分析提出了挑战。本RM不用于评估其他生物信息学步骤,如菌株鉴定、系统发育分析或基因组注释。基因组DNA的纯度被评估为适合这些目的。


储存和使用说明:

储存:

RM 8375在NIST储存在-20°C下,但将与冷冻包一起运输,可能不会冷冻到达。收到后,RM 8375应在-20°C的黑暗中长期储存,或在4°C的阴暗中短期储存(如果使用可能在大约8周内)。


使用说明:

建议使用基因组序列来评估变异调用的准确性,而不是基因组组装,因为正交测量方法对基因组序列结构存在分歧,无法解决这些差异。由于用于评估碱基调用准确性的方法的复杂性以及基因组序列中潜在的错误,强烈建议用户人工检查具有高碱基调用错误率的推定区域周围的对齐读取。参考文献3概述了评估微生物基因组中变异调用的最佳实践。

这些组件基于多种测量方法的数据;我们使用多种正交方法对材料进行了评估,以尽量减少与单个平台相关的系统误差的影响。这些数据可在国家生物技术信息中心(NCBI)序列读取档案(SRA)中获得,分别为MG-001、MG-002、MG-003和MG-004的生物样本SAMN02854572、SAMN02854573、SAMN02954574和SAMN02854275[4]。随着测序技术和分析方法的改进,基因组序列将在Github网站上更新并可用(见上文“信息值")。新的版本号将指示更新的基因组序列以及描述更改的文本文件。识别参考基因组中错误的用户可以在参考文献5所示的网站上发布他们的结果,确认的错误将被纳入下一次序列更新中。


美国NIST RM 8375 微生物基因组DNA标准品   原厂订货,货期短,质量保证,售后完善。


美国NIST RM 8375 微生物基因组DNA标准品


本公司保证全程采用美国NIST的运输条件进行产品运输。


部分美国NIST标准品产品列表:

SRM 123c不锈钢,Cr-Ni-Nb (AISI 348)
SRM 634a波特兰水泥
SRM 3667冷冻人尿液中的肌酐
SRM 1598a动物血清中的无机成分
SRM C1291高合金白口铸铁(Ni-Hard,I 型)
SRM 1738锌铝合金
SRM 182锂矿石(透锂长石)
RM 8260婴儿营养配方奶粉(以水解奶为基础)
SRM 2561Low-Energy Charpy V-Notch Specimens
(NIST-Verification, 21 °C, 8 mm Striker)
SRM 1488聚(甲基丙烯酸甲酯)29 K 窄分子量分布
SRM C1151a不锈钢23Cr-7Ni
SRM C1296不锈钢
SRM 864镍合金UNS N06600(芯片形式)
SRM 2696硅灰(粉末状);硅粉
SRM 185i酒石酸氢钾(pH 标准)
SRM 706a聚苯乙烯(宽分子量分布)
SRM 1888b波特兰水泥标准物质


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